Change the $this->registry big three arrays to also use bugdar

Change the big three $bugsys arrays to be a bugdar class

class_mo.php

global.php is now converted

Fixing an $funct issue and do not load Mail in init.php

Updating the auth/ system to ISSO3

init.php is now largely upgraded

Templates XHTML compliance fixes

Nearly all modified templates had a issue of:
 - no xmlns tag inside of the html tag
 - no type tag inside the stylesheet link rel's
 - no /> for some form elements

bugfield_input_text was missing a ending > for maxlength that made the output
visually break, and push everything onto one column, also making validation fail.

There are other validation warnings, such as for empty options in select fields
among others, but those are non-offensive, thus they don't exactly need attention.

Signed-off-by: Elisamuel Resto <ryuji@sourcemage.org>

Load ISSO3 support alongside ISSO2

* includes/init.php

Adding the ISSO submodule

Adding a .gitignore file

r1620: Custom, mandatory select fields didn't accept the first option as valid. Fixes bug 121.

* includes/functions.php:
(process_custom_fields)

r1618: Making a note for users to backup includes/config.php when upgrading

* UPGRADING

r1613: Merging r1611 and r1612 from the 1.2.x branch to the trunk (upgrade script stuff)

r1612: Adding the 1.2.2 version into the installer version list

* install/global.php

r1611: Adding the installer script and template diff for the 1.2.2 release

* install/upgrade17.php: New file
* install/templates/1.2.1 - 1.2.2.diff: New file

r1610: Because ISSO is now in a git repository, we are merely going to add the last revision of ISSO2 to the Bugdar source tree to simplify the release process

r1609: Merging the changelog from r1608 from the 1.2.x branch to the trunk

r1608: Merging r1607 from trunk

r1607: Updating all the language strings to use T() instead of _() so we can use our new custom MOReader class instead of the built-in Gettext extension.

r1606: Merging the changes from r1605 from trunk to branch. Fixes bug://report/120

r1605: Comments posted by guests can now be deleted. Fixes bug://report/120

* docs/changes.txt: Changelog update
* includes/api_comment.php: Remove the relation on the Comment.userid field
* editcomment.php: Because we removed the relation on Comment.userid, we need to manually get the user info

r1604: Merging the changes from r1603 from the trunk to the branch

r1603: Fixing a small variable capitalization error

* includes/auth/auth.php:
(Authentication::_createBugdarUser): Changed $authDb to $authdb

r1602: Merging r1601 from trunk to the branch

r1601: The installer wasn't running with the database in UTF8 mode (even if the config directive stated to do so). Therefore, this would break certain installations.

* install/global.php: Adding a SET NAMES query
* docs/changes.txt

r1600: Merging r1599 from trunk to fix bug://report/97

r1599: Fixed bug://report/97. If a user had selected a language that had since been deleted, the email notification system would fail because the template paths it would try to load wouldn't exist becuase the langcode wouldn't be added.

* docs/changes.txt
* include/class_notification.php:
(NotificationCenter::_localeFromUserId): Instead of checking if the language ID exists for the user, get the langcode for the user's language and check if *that* exists

r1598: Forgot to add a TABLE_PREFIX to the query to get custom fields

* Source/class_sort.php:
(ListSorter::_fetchCustomFields): Add a TABLE_PREFIX to the non-permissions based query

r1597: Adding custom columns to the bug listing display. Fixes bug://report/73

* includes/definitions.php: Removed
* includes/init.php: Do not include definitions.php anymore
* includes/class_sort.php:
(ListSorter::fetch_by_text): Fetch custom fields when getting the text information
(ListSorter::constructColumnHeaders): Use fetch_by_text() instead of $bugsys->columnNames[]
(ListSorter::_processColumns): Use fetch_by_text() instead of $bugsys->columnNames[] and make sure that the columns the user has selected actually exist (namely for permissions sanity)
(ListSorter::_fetchCustomFields): New method that returns all the custom fields in the system, or just the ones the user can see, based on a parameter

r1596: * templates/header.tpl: Moving the inline styling for the quicksearch to be in #quicksearch
* templates/global.css: Adding #quicksearch definition

r1595: Branching the trunk into the 1.2.x maintenance branch

r1594: Fixes bug://report/95

Do not show the version number on non-admin pages.

* templates/footer.tpl: Rework the copyright text around not having a version number

r1593: Fixing bug://report/93

After mass-updating a search where the criteria were changed, a user would be stuck in a "no results" error.

* search.php: Adding a link to create a new search on a "no results" error

r1592: Adding a file that caches all the templates in Bugdar to the database

r1591: Fix the user approval system by actually getting email templates correctly

r1590: Fix a "Call-time pass-by-reference has been deprecated" on search.php line 602

r1588: Adding a copy of the license into the folder, and adding it to the packager

r1587: Adding the release preparation script

r1586: Fixed a stupid parse error

r1585: Forgot to bump the version

r1584: changes++

r1583: - If the version is bad, send them to upgrade16.php in hopes of fixing the problem
- Add upgrade16.php

r1582: We no longer can trust the tag variable substitution for PHP files. Changing the way we use Budar's version number.

r1581: Fixing a bug where we weren't properly setting $search variables in search.php which was making us rerun a search twice before newly-modified results would show up

r1580: In the INSTALLING and UPGRADING document, add a note about removing install/global.php

r1578: Updating en_US.pot

r1577: Adding the template changeset file

r1576: Dumping the latest settings file

r1575: - Adding the 1.2.0 upgrade path in install/global.php
- In install/upgrade.php add some further checks to see if the stored version is invalid

r1574: In NotificationCenter::_localeFromUserId() we now take into account when the language isn't set that we should use the default one

r1573: Adding the upgrade script for 1.2.0

r1572: There will be no RC2... we're going final

r1571: Removing trailing whitespace on login.php

r1570: We are no longer going to tell people to convert their databases, if they have problems, they can come and talk to us

r1569: Added improvements to convert_database_charset.php

r1568: We  now properly tell MySQL to use utf8 and we send a content-type header along with it, though it's an option in config.php so that people who don't use utf8 MySQL don't have problems

r1567: In NotificationCenter::finalize() tell the XML parser to use utf8

r1566: Fixed an issue where header names weren't translated due to the fact that $bugsys->columnNames[] was being loaded (with gettexed strings) before the language system was initialized

r1565: New bug notifications would have a template-not-found error because the langcode wasn't being calculated because we're loading the NotificationCenter->users[] array too late

r1564: changes++

r1563: Fixed a minor spelling error in activateaccount.xml.tpl

r1562: - Moving email templates into the locale/ directory so they can be translated into different languages
- Adding FetchEmailPath() so that the email template path doens't have to be given every time (since it is rather long)
- Updating all the locations where we send emails to use the new paths

r1561: Removing the accidential "A" put in check_bug_permissions() that I now just realized causes an error

r1560: In vote.php, we sanitize the vote value as UINT when it should be INT to allow users to vote against bugs. Closes bug://report/84

r1559: Closing a SQL injection in register.php with the activationid

r1558: In userctrl_search.tpl, the floated elements need to be before unfloated ones otherwise Gecko engine offsets it by a line

r1556: Add another check on the table column conversions to ensure that it's only text and char data that we're converting

r1555: We aren't doing a final release, we're at RC1 so update the changelog to reflect that

r1554: changes++

r1553: Updating the en_US.pot file

r1552: Adding the template diff for 1.2.0 RC1

r1551: In login.php, $message->items would never be filled because it doesn't actually exist in MessageReporter, instead we should use $message->hasErrors()

r1550: Adding the initial planning document for 2.0, which is still a ways off

r1549: Change the collation of the database to be 'utf8_general_ci' before we begin creating tables

r1548: Add an additional stop for the upgrade system in upgrade14.php that encourages users to convert to utf8 MySQL

r1547: Adding the upgrade14.php script which runs the upgrade to 1.2.0 RC1

r1546: Adding convert_database_charset.php

r1545: Adding the text-align attribute to the mid box section of the showreport_comment.tpl so that RTL comments are displayed RTL. Fixes bug://report/80

r1544: Adding an 'assignedto' formatter in ProcessBugDataForDisplay()

r1543: Adding the "assigned to" column to the display grid, and enable sorting
for it

r1542: Adding the post-commit hook example for SVN

r1540: Updating the schema file

r1539: Add another step to the release procedure (updating the schema file)

r1538: Rebuild all the caches in install/upgrade13.php just to be safe because I think there may be some bad data from pervious installs... and it can't hurt (actually, we may want to do it after every upgrade)

r1537: Adding the version record for 1.2.0 Beta 3 to install/global.php

r1536: - Adding the template diff for 1.2.0 Beta 3
- Updating the en_US.pot language file

r1535: Make sure we changemod the files we write to

r1534: We want to remove that call to error_reporting()... woops

r1533: Apparently some systems don't like our pass-by-reference use of ProcessBugDataForDisplay(), so change it to be used with an assignment operation instead. Closes bug://report/78.

r1532: We need to call build_settings() after we set them

r1531: Adding upgrade13.php which fixes some previous issues

r1530: Adding an installer check in install/install.php to prevent people from attempting to install without the right MySQL permissions

r1529: Change the trackerversion setting to be [#]version[#]

r1528: In install/installer.php:
- Move the data caching system up to be right after we load settings and default data
- Call build_usergroups() right before we insert the new admin user, removing the problem of the usergroup datastore not being built for build_assingedto()

r1527: Forgot to add the groupids column to the schema

r1526: In includes/class_notification.php#fetch_user_cache(), we no longer want to clear the roles[] array because it would actually prevent emails from being sent due to the way we use set_bug_data() in editreport.php

r1525: Attach &rerun=1 to the URL for saved searches when running them from the "Options" tab

r1524: In BugAPI::set(), we can't use our pretty call_user_func_array() logic, but rather we now have to do a physical call to parent::set() because of stupid PHP4

r1523: In passwordreset.xml.tpl, we need to enclose the trackertitle variable in curly braces so it doesn't come out as "Array['trackertitle']" in actual emails