Fixing some things in the Printer system

* Printer.php: include PrinterNavigation.php
* PrinterRootElementPage.php:
(BSPrinterRootElementPage::get/setNavigator): Renamed from get/setNavigation()
(BSPrinterRootElementPage::paint): Fix a parse error caused by a missing concat op

Instead of using the registry to get the PrinterNavigation system, add methods to set BSPrinterRootElementPage->navigator

* PrinterRootElementPage.php:
(BSPrinterRootElementPage::setNavigator): New method
(BSPrinterRootElementPage::getNavigator): New method

We now pass the installer test again, the issue was that InstallerTest->input wasn't being set. The circular ref to the rig in TestInstallerFixture was also cleaned up

* UnitTest/InstallerTest.php

Removing the PHP tests because we have now implemented our conclusions

Adding fixes in the unit tests for all the refactoring we did

Removing the BSVariableRegistry and instead making public static vars in BSApp for the necessary inter-linking modules

* Api.php: No longer use BSApp::registry() but rather just the cvars
* App.php: Make the ivars cvars so we no longer need singleton stuff
(BSApp::_instance): Removed
(BSApp::registry): Removed
(BSApp::load_module): Removed, just directly instantiate now
(BSApp::required_modules): Removed
(BSVariableRegistry): Removed
* Input.php: Use cvars instead of the BSApp::registry()
* Installer.php: ditto
* Mail.php: ditto
* Pagination.php: ditto
* Template.php: ditto

Removing a lot of old system variables from BSApp

* App.php: Removed BSApp->application, BSApp->appPath, BSApp->appVersion, BSApp->webPath
(BSApp::set_application): Removed
(BSApp::get_application): Removed
(BSApp::set_app_path): Removed
(BSApp::get_app_path): Removed
(BSApp::set_app_version): Removed
(BSApp::get_app_version): Removed
(BSApp::set_web_path): Removed
(BSApp::get_web_path): Removed
* Printer.php: Add BSPrinter->copyright to store copyright information for the footer of pages
(BSPrinter::get_copyright): New method
(BSPrinter::set_copyright): New method
* PrinterNavigation.php: BSPrinter->realm is now the only component used for titles
(BSPrinterNavigation::constructHeaderHtml): Now uses only the realm
* PrinterRootElementPage.php: Again, only use BSPrinter->realm
(BSPrinterRootElementPage::paint): Switch to using only the realm in the title and using BSPrinter->copyright in the footer

Fixing a few functions that broke during the refactoring

* Functions.php:
(BSFunctions::swap_css_classes): This function wasn't marked static so it wasn't refactored, fixed both of those issues
(BSFunctions::scan_directory): Issues arose with _help_scan_directory()
(BSFunctions::_help_scan_directory): ditto

Refactoring all the static functions to not use the upper camel-case nomenclature, but rather underscores

We need to throw Exceptions rather than trigger_error()

* PrinterNavigation.php:
(BSPrinterNavigation::setFocus)

Setting up the fluent interface for all of the printer classes

Start providing a fluent interface for the printer stuff. All printer elemnets now have a make() method that calls the constructor

Happy new year!

Removing the CSS editor generator

* PrinterCss.php: Removed

Removing the graphing files

* Graph.php
* GraphLine.php
* GraphPie.php

The API is now all unit tested

* Api.php
* UnitTest/ApiTest.php

Removing the XML class because we will now use SimpleXML for all our parsing needs

* UnitTest/AllTests.php: do not include the XML tests anymore
* UnitTest/XmlTest.php: Removed
* Xml.php: Removed

Unit test updates

* UnitTest/ApiTest.php

Fixing some warnings that I discovered through unit testing under E_ALL

* Functions.php:
(BSFunctions::FetchMicrotimeDiff): Refactored the local vars
* Template.php:
(BSTemplate::fetch): Fixed a warning generated by the uncached template counter
(BSTemplate::flush): Fixed a warning about the microtime diff because we weren't passing a microtime, just the seconds

Cleaning up the Api::_runActionMethod() method

* Api.php:
(BSApi::_runActionMethod): Don't use the ternary operator, just use the if() statment at the beginning

Renaming Api->objdata to be Api->record

* Api.php

Adding a testCondition() method to the API test

* UnitTest/ApiTest.php

Add thed API unit tests

When the API needs to throw an exception regarding a field, use a new FieldException which holds the name of the field as well as the error.

In Api.php we were still calling BSApp::GetType() instead of BSApp::Registry()->getType()

* Api.php

Adding the API::$table and API::$prefix instance variables so that subclasses know to override them

* Api.php

Changing the error reporting system in the API to use exceptions instead of the old error handler system of before

* Api.php

Changing the way we include framework files. Instead of modifying the include_path we just define the constant ISSO as the path to ISSO.

Cleaing up error reporting and error triggering in Api.php

* Api.php: Removed the APIError() system and we now use exceptions instead of trigger_error()

Fix a failing unit test to work around the file system being slow

* UnitTest/TemplateTest.php:
(TemplateTest::testDbCache): sleep() for a second in order to allow the file system to catch up to the changes we're making

Moving the insertId() and affectedRows() methods from the result class to the database one and fixed a broken BSDbResult::free

* Db.php
* DbMySql.php
* DbMySqlI.php
* DbPostgreSql.php
* UnitTest/DatabaseTestAbstract.php

Database results are now independent objects as opposed to being a resource identifier, which greatly simplifies method calls

* Db.php
* DbMySql.php
* DbMySqlI.php
* DbPostgreSql.php
* Template.php
* UnitTest/DatabaseTestAbstract.php

In the installer test, the welcome page is to be echo'd instead of return'd

* UnitTest/InstallerTest.php:
(TestInstallerFixture::_welcomePage)

Fixing a broken unit test

* UnitTest/AppTest.php:
(AppTest::testGetAll): The count was off by one due to a new method

Added the installer unit test

* Installer.php:
(BSInstaller::__construct): Fixed a bad call to the registry
* UnitTest/AllTests.php: Add the installer test
* UnitTest/InstallerTest.php: New file

Remove the check in BSApp::RequiredModules that was meant for checking static classes (as we don't need it)

* App.php:
(BSApp::RequiredModules)

Fixing some bugs in the mail framework due to mistyped variable capitalization and a call to $this->registry->unsanitize()

* Mail.php:
(BSMail::send)

Fixing another call to BSApp::GetType() and switching to using the ::Registry()

* Mail.php:
(BSMail::send)

Removing the old ReigsterTest.php

* UnitTest/RegisterTest.php: Removed

Removing the old coverage reporter from the unit test system

* UnitTest/Coverage.php: Removed

Use (c) instead of the actual copyright symbol to avoid the really annoying character encoding issues

Removing all the package replacement tags and SVN keyword tags

Finishing the template unit test

Fixing more instances of BSApp::GetType()

* Template.php:
(BSTemplate::flush)

Added tests for template preparse hooks and the cache system

* UnitTest/TemplateTest.php

Discovered another older style of accessing the registry

* Template.php:
(BSTemplate::cache): Use the new BSApp::Registry() system

Fixing the include path for docs/tools/create_schema.php

* docs/tools/create_schema.php: Hard-coding our include path

Adding a TemplateTest.php file and all the associated template files along with it

Removing dead function in Template.php

* Template.php:
(print_around): Removed

Removing the usage counter in from the template system

* Template.php:
(BSTemplate::cache): No longer initialize the usage counter
(BSTemplate::fetch): Only increment the BSTemplate->uncached[] template counter when the template is not cached
(BSTemplate::flsuh): Remove the template debug block and only show uncached templates and their usage

Removing the SVN constant option and the ISSO_MT_START (thanks to $_SERVER['REQUEST_TIME'])

* Template.php:
(BSTemplate::flush): No longer display SVN information and we can use $_SERVER[REQUEST_TIME] so we don't need to define ISSO_MT_START
* App.php: Remove documentation about constants

Simplifying the loading of templates so we don't have two exceptions to throw for the same type of error

* Template.php
(BSTemplate::_loadTemplate): Check if the path is a file and can be read, instead of checking the result of file_get_contents() becaues that way we don't throw multiple exceptions in the same method unnecessarily

Do not use BSApp::GetAppPath() anymore for the template path, but instead use a fully-qualified path in BSTemplate->templateDir

* Template.php:
(BSTemplate::cache)
(BSTemplate::_loadTemplate)

Making the two MySQL tests create an InnoDB database so that we can practice our new transaction test

* UnitTest/DatabaseMySQLTest.php:
(DatabaseMySQLTest::setUp): Create the test table as InnoDB
* UnitTest/DatabaseMySQLiTest.php:
(DatabaseMySQLiTest::setUp): ditto
* UnitTest/DatabaseTestAbstract.php:
(DatabaseTestAbstract::testTransactions): New method

Moving the tools/ directory to the docs/ folder

Moving the UnitTest directory out of the docs/ folder and into the root of the framework

Removing dead files that we no longer need

Fixing a call to BSApp::GetType() that no longer exists

* App.php:
(BSApp::RequiredModules)

Forgot to change our require_once() in our unit test for AppTest

* docs/UnitTest/AppTest.php:
(AppTest::setUp): Change the require_once() path

Fixing "method not found" for BSApp::GetType()

* Input.php:
(BSInput::escape)

Renaming BSRegister to BSApp and moving Register.php to App.php

Updating the unit tests for preparation of renaming BSRegister to BSApp

Changing the registry part of BSRegister to be a new inner class called BSVariableRegistry

* Register.php:
(BSRegister::__construct): Instantiate a new instance of BSVariableRegistry
(BSRegister::Registry): New method
(BSRegister::Register): Removed
(BSRegister::Unregister): Removed
(BSRegister::Get): Removed
(BSRegister::GetType): Removed
(BSRegister::GetAll): Removed
(BSVariableRegistry): New class
* docs/UnitTest/RegisterTest.php: Updated the unit test for the new BSRegister functionality

Remvoing all the methods in BSRegister that handle error reporting

* Register.php:
(BSRegister::Message): Removed
(BSRegister::_errorHandler): Removed
(BSRegister::ExplainErrorReporting): Removed

Switching from calls to trigger_error() to throwing generic exceptions for client implementation errors

* Installer.php
* Template.php
* PrinterBaseElement.php
* PrinterTableElement.php
* PrinterRootElementTable.php
* Mail.php

Suppress errors in connecting via MySQLi

* DbMySqlI.php:
(BSDbMySqlI::_connect): Suppress the errors in our call to mysqli_connect

Renaming the transaction*() methods to just be the type of transaction statement to send, and removing savepoint support

* DbMySql.php
* DbMySqlI.php
* Db.php
* DbPostgreSql.php

Removing a call to _error in DbMySql.php because it's no longer needed with exceptions

* DbMySql.php:
(DbMySql::_selectDb)

Adding database unit tests and in the Db module, use a new DatabaseException class intead of triggering errors

Don't quote certain MySQL values

Updating create_schema.php to work with the new ISSO3 stuff

- Switch to using Exception in Xml.php, Register.php, and Input.php
- We now have a fully working test suite again

Our test suite is now done with PHPUnit, although it's rather broken

* tools/ISI_PHPUnit2_Output_HTML_Listener.php: Removed because we added it already.

Removing the pconnect option from BSDb and it's children.

* Db.php:
(BSDb::connect): Removing the $pconnect paramater
(BSDb::_pConnect): Removed.
* DbMySql.php:
(BSDbMySql::_pConnect): Removed
* DbMySqlI.php:
(BSDbMySqlI::_pConnect): Removed
* DbPostgreSql.php:
(BSDbPostgreSql::_pConnect): Removed

Starting to migrate from SimpleTest to PHPUnit.

* docs/UnitTestReport.php: Renamed to SimpleTestReporter
* docs/UnitTest/AllTests.php: Changing the path to the test reporter, see above.
* docs/PHPUnitTestReporter.php: Added

Adding the results  of testing with PHP5

Adding PDO tests

Moving imported tools into the tools/ directory

Merging the php520 tests from the branch

Importing tools to ISSO

Adding date tests

Adding a few tests of PHP5's new features

Branching the ISSO3 trunk in experimenting with the new features of PHP 5.2.0

Merging changes from the 2.1.x branch back to trunk (r860-862)

In mail.php, we don't want to double encode fields so in send() create local variables instead of using object properties

Change Mail::_encodeHeaderValue() to use regexp instead of a for() loop

Adding Mail::_encodeHeaderValue()

In xml.php, the default should be utf8 and when using it, we don't want to call utf8_encode()

In BSApi::fetch(), remove the code that populated BSApi->values[] with the objdata result

Adding a verify_unique() method to BSApi

In Api.php, TYPE_NOCLEAN no longer exists as it was replaced with TYPE_NONE

Modifying the error handling system in BSApi so that errors generated from validating data that's only used to fetch are ignored

In BSRegister::RequiredModules, we forgot a word in the error message

Removing the Markdown parser because we don't need it really

Optimizing BSFunctions::Random() ever so slightly so we only need one loop instead of many

- In Pagination::constructPageNav() we added the $addParam paramter to not force adding the ? or & onto the end of $baselink
- Fixed "Call to undefined method BSInput::input_clean()"

Remove a potential warning in BSRegister::_errorHandler() due to an array index

Don't call intval() on the percentages because then we can end up with bad data sets

Removing BSTemplate database-driven system in place of BSTemplateFs (which is now called BSTemplate) because we never use database-driven templates any more, but rather file templates with database caching